1951年，由傅灿冰、戴汉香、杨仕清、漆树龙、李培根等10名中医前辈共同出资4460元组建了江津中医院的前身—--江津县城关第一联合诊所。

1955年，从江津本县各地调来刘国衡、祝英杰、刘永田等名中医充实医院人才队伍。到1956年，原有小什字门诊业务用房得到扩大，并由原来的一个门诊扩大为三个门诊，拥有职工50名，遂更名为“江津县城关联合诊所”。

1958年，医院规模进一步扩大，发展到五个门诊，职工增加到98人，业务用房3000多平方米，更名为“江津县城关人民公社医院”。广大中医工作者凭借“三个指头、一个枕头”为广大人民群众解除疾苦，铸就了全国名中医任应秋、傅灿冰，四川省名中医戴汉香、刘国衡、祝英杰等。

1993年，四牌坊大楼投入使用，年业务收入突破183万元。

2003年，小什字综合楼投入使用，当年业务收入突破1000万元。

2007年3月，江津撤市设区，医院遂更名为“重庆市江津区中医院”。至2011年，医院业务收入突破亿元大关。

2013年2月27日，德感新院投入使用，形成南北两岸的运行格局。该年度业务收入突破1.8亿元。

2014年3月10日，医院召开创建三级甲等中医院再动员大会，全面启动三甲创建工作。该年度业务收入突破2.4亿元。

2015年12月24日，经国家中医药管理局医政司审核，正式批准我院为国家三级甲等中医院，编号：ZYSJ423007（渝中医【2015】77号）。建设国家名老中医周天寒工作室并获得验收，该年度业务收入突破2.5亿元。

2016年2月4日，重庆市卫计委批复我院编制床位从原来的580张增加到850张。该年度业务收入突破2.9亿元。

2017年2月20日，医院正式成为湖北中医药大学教学医院并举行挂牌仪式。该年度业务收入突破3.2亿元。

2018年3月13日，医院与全国名老中医王辉武、郭剑华正式签订全国名中医传承工作建设合作协议，全国基层名中医张安富工作室建设项目落户医院。该年度业务收入突破3.4亿元。

2019年5月3日，医院与中国工程院院士、国医大师、现代中国针灸奠基人石学敏院士签订合作协议。7月，中华诗词学会授予医院“中华诗教先进单位”荣誉称号。该年度业务收入突破3.6亿元。